Bem, acabou sendo um problema de tema!
Qualquer um dos temas Unity, Ambiance ou Radiance, mostraria o problema.
A escolha do tema padrão do GNOME, o Adwaita, resolveu o problema!
Problema estranho que está ocorrendo há alguns meses ... provavelmente devido a uma atualização de software do sistema ... meu palpite.
Todas as janelas de aplicativos agora têm uma linha de aproximadamente 1 pixel onde a área de trabalho é exibida e os ícones da área de trabalho ficam visíveis.
Aqui está uma captura de tela que mostra o problema ...
Alguma ideia do porquê?
Bem, acabou sendo um problema de tema!
Qualquer um dos temas Unity, Ambiance ou Radiance, mostraria o problema.
A escolha do tema padrão do GNOME, o Adwaita, resolveu o problema!