Eu encontrei uma solução para fazer o novo disco funcionar.
Eu iniciei com o Ubuntu 17.04 iso via usb stick.
sudo bash
mount /dev/sda1 /mnt # sda1 is the new installation which did not boot
cd /mnt/
mount -t proc proc proc/
mount -t sysfs sys sys/
mount -o bind /dev dev/
chroot .
grub-install
update-grub
exit # exit chroot
reboot