Acredito que isso seja um erro, e a única solução é definir suas opções para "Não fazer nada".
Muito simples, na verdade
vá para System Settings
e clique em Power Settings
Defina as opções When the Lid is Closed
como Do Nothing
Agora você pode fechar sua tampa e seu laptop não será desligado.
Se o seu monitor externo fica preto basta mover o mouse ou clicar no botão do mouse e ele deve voltar a ligar, e seu monitor externo será agora o seu monitor principal.
PS. Você também deve enviar um relatório de bug para este problema.