Isso significa que o UID atual que você está usando não está presente em /etc/passwd . Este não é um problema sério se a administração do seu sistema sabe o que ele está fazendo. Você pode conferir usando:
strace -f -F -o whoami whoami
Então agora você tem um arquivo chamado whoami , analise:
grep etc whoami
[...]
5029 open("/etc/passwd", O_RDONLY|O_CLOEXEC) = 3