Estou executando o 16.04 com dois monitores. Um é conectado via vga na minha placa-mãe e o outro via displayport na minha placa gráfica (Nvidia). Ao retornar de uma suspensão, durante a qual ambos os monitores estavam funcionando corretamente, somente o monitor vga exibe a tela de login e o DP não é sequer detectado. Minha placa gráfica ainda é detectada executando o driver mais recente. O problema ocorre apenas quando o sistema foi suspenso por um período de tempo considerável (horas).
EDIT: Meus gráficos integrados são os de um Intel i5-6500.
Saída de lspci -nnk | grep -A3 -Fe '[0300]' (durante a edição):
nick@nick-ubuntu-16-04lts:~$ lspci -nnk | grep -A3 -Fe '[0300]'
00:02.0 VGA compatible controller [0300]: Intel Corporation Sky Lake Integrated Graphics [8086:1912] (rev 06)
DeviceName: Onboard IGD
Subsystem: ASUSTeK Computer Inc. Skylake Integrated Graphics [1043:8694]
Kernel driver in use: i915
--
01:00.0 VGA compatible controller [0300]: NVIDIA Corporation Device [10de:1b81] (rev a1)
Subsystem: Micro-Star International Co., Ltd. [MSI] Device [1462:3302]
Kernel driver in use: nvidia
Kernel modules: nvidiafb, nouveau, nvidia_384_drm, nvidia_384
EDIT2: Sugestão de Per David Foerster eu vinculei os logs -
/var/log/Xorg.0.log
/var/log/pm-suspend.log --- Não existe