O problema pode ser resolvido isolando o dispositivo de entrada específico com xinput . Desativar um dos dois dispositivos idênticos PS / 2 Genérico Mouse resolveu todo o problema.
Em suma, digitei xinput list , decidi em um dos dispositivos ( id=18 no meu caso) e digitei xinput disable 18 . Isso resolveu o problema, então criei um item na lista Programas de inicialização com esse código, para que ele seja executado na inicialização. O problema não retornou desde.