Você pode tentar removê-lo e reutilizar o apt-get update.
Faça o seguinte
sudo rm /etc/apt/sources.list.d/medibuntu.list
Eu recebi o seguinte erro ao tentar executar sudo apt-get update no Ubuntu 16.04.
predator@kmb:~$ sudo apt-get update
[sudo] password for predator:
E: Type '<!DOCTYPE' is not known on line 1 in source list /etc/apt/sources.list.d/medibuntu.list
E: The list of sources could not be read.
predator@kmb:~$
Você pode tentar removê-lo e reutilizar o apt-get update.
Faça o seguinte
sudo rm /etc/apt/sources.list.d/medibuntu.list