Eu não posso testar agora no Ubuntu GNOME, mas no Ubuntu 14.04 sob as configurações "Mouse e Touchpad" existe uma opção para "Desativar enquanto digita":
Como o 14.04 usa as mesmas configurações do GNOME, acho que isso deve ser semelhante para a sua versão. Tente desmarcar a caixa e ver se isso está resolvido.