A solução para esse problema é um pouco óbvia nos olhos.
- comecei criando o array raid
- instalado no ubuntu 16
- reinicializado usando o live usb
- selecionou "tente" o ubuntu e passou pelas opções de reparo de inicialização detalhadas aqui: link
- Em seguida, siga as diretrizes da partição de inicialização aqui: link
- reinicializar
Para referência, o passo 5 é a resposta à minha pergunta, enquanto os passos 1-6 cuidam do meu problema geral.
Ele inicializou muito bem. Espero que isso ajude os outros com problemas semelhantes.