Você pode executar este comando no terminal:
mysql -u [username] -p[password] -D [databaseName] -h [hostName] -e 'DROP TABLE [tableName];'
Substitua todas as palavras entre colchetes pelas credenciais reais do banco de dados.
Note que não há espaço entre -p e a senha. Se você deixar um espaço entre eles como outros argumentos, a linha de comando solicitará que você digite a senha.