Deve ser o mesmo que qualquer instalação para uma segunda unidade. E você quer uma partição efi na unidade flash e no grub instalada nessa unidade.
Mas quando instalei um segundo Ubuntu no meu HDD, ele substituiu a partição efi no meu SSD. Então faça o backup da partição efi da unidade principal. Você pode então apenas copiar a partição efi da unidade principal para a unidade flash, se ainda sobrescrever. Eu tenho certeza que escolhi instalar o grub na minha unidade sdb na instalação do Something Else.
Crie primeiro a partição efi com o particionamento gpt na unidade flash.
Ainda é possível instalar o Ubuntu em um disco rígido externo com UEFI?