Eu tenho um pad com 2 pads analógicos. Se eu me mover primeiro um (do lado esquerdo), ele move o cursor do mouse que retorna ao centro da tela. O segundo não faz nada, mas mover o bloco para o lado direito teleporta o mouse para o centro. Isso é muito chato, especialmente quando eu quero jogar. Eu uso o Ubuntu 16.04 se esta informação for necessária
Você verificou a compatibilidade do driver com o seu gamepad?
Se você estiver procurando uma correção temporária, use o seguinte código:
sudo modprobe -r psmouse
Isso desativará a entrada no cursor da tela. Para ativá-lo, insira isto:
sudo modprobe psmouse proto=imps