Estou me fazendo a mesma pergunta. Os snaps KeepassXC e Libreoffice, por exemplo, possuem um pequeno ponteiro do mouse. Principalmente para o LibreOffice, este é um problema chato, porque quando você usa Write você nunca sabe onde o mouse está. Talvez isso tenha a ver com as bibliotecas gráficas usadas para criar esses aplicativos. De qualquer forma, isso é um problema em dispositivos HDPI.