O clonezilla é um excelente programa clone de discos / partições.
obtenha uma imagem de inicialização ao vivo aqui: link
baixe a imagem e grave-a no cd.boot do cd.
o programa tem uma inteface grapfica que o guia através dele.
a partição clonada terá o mesmo uuid que o original, então faça o login no Ubuntu e use o gparted para gerar um novo uuid para o clone.
último grub de atualização para adicionar o novo ubuntu ao menu.