Eu resolvo esse problema alterando as regras apparmor em /etc/apparmor.d/usr.sbin.named .
Eu editei o arquivo e mudei a linha:
%código%
para
/etc/bind/** r,
e depois:
/etc/bind/** rw,
Essa alteração também impede a permissão de erros negados ao salvar arquivos em
service apparmor restart
service bind9 restart
.