Consegui consertar. http://debian.sur5r.net/i3/ (quantal, universo) não respondeu. Depois de desativá-lo, apt-get update é bem sucedido.
Dicas para o próximo problema que se depara:
- Inicie o
synaptice desative as origens até queReloadnão seja mais interrompido. Especialmente, fontes de terceiros parecem ser candidatas. - Reactive suas fontes até atingir a que causa problemas.
synaptic é ótimo para diagnósticos. Quando Reload trava e você aborta, ele imprime o repositório atual. No meu caso, foi exatamente o pior:
Failed to fetch http://debian.sur5r.net/i3/dists/quantal/InRelease
Some index files failed to download. They have been ignored, or old ones used instead.