Em 12. Configure theano para usar GPU por padrão , ele pede para copiar algumas strings entre aspas. Infelizmente, se você observar mais de perto, essa página exibe algumas aspas especiais, que não são reconhecidas pelo terminal como sendo. Compare "algo" e "alguma coisa". Executando este comando você simplesmente adicionou isto e mudou o significado (veja a última linha do seu Traceback - > '“....“').
O que você quer, em vez disso, é essa linha (ou colar desse site, mas as citações corretas):
echo -e "\n[global]\nfloatX=float32\ndevice=gpu\n[mode]=FAST_RUN\n\n[nvcc]\nfastmath=True\n\n[cuda]\nroot=/usr/local/cuda" >> ~/.theanorc