Eu aposto que tudo o que desapareceu são links simbólicos e arquivos de desktop, não aplicativos e arquivos de dados reais. Eu não sei muito sobre o Compiz ou Unity, mas eu suspeito que você poderia ir para / usr / share / applications e copiar os arquivos da área de trabalho que você quer ser capaz de lançar de ícones na sua área de trabalho para / home / your-user-name / Desktop /
Para acesso direto aos diretórios (também conhecidos como "pastas") da sua área de trabalho, você pode criar novos links simbólicos e colocá-los em / home / nome do usuário / Desktop /
Para cada diretório:
ln --symbolic -T /actual/path/to/directory /home/your-user-name/Desktop/whatever-you-want-to-call-the-link
Provavelmente você excluiu algo que diz ao Compiz para colocar essas coisas lá, então tente colocá-las por conta própria.
Se isso não funcionar, tente reinstalar o compiz.
No futuro, NUNCA apague qualquer tipo de arquivo de configuração sem fazer uma cópia de segurança.