Este é o problema com o uso de usbs normais para instalar o ubuntu. Eu encontrei o mesmo problema quando instalei o Ubuntu em um usb. No entanto, assim que eu coloquei no disco rígido do meu computador, ele acelerou bastante.
Se você realmente quiser colocar o ubuntu em um usb, eu teria pelo menos um usb 2.0, mas provavelmente um 3.0. Eles são muito mais rápidos, fazendo o sistema funcionar mais rápido.
Importante:
Certifique-se de que seu computador / laptop suporte USB 2.0 / 3.0. Caso contrário, você não terá qualquer diferença em usar o USB 2.0.
Veja aqui para uma comparação das diferentes versões de USB