Parece que você está tentando desativar algo que não está habilitado no momento. Verifique a saída deste comando:
systemctl status systemd-timesyncd.service
Veja a linha Loaded:
. Diz "ativado" ou "desativado"?
Veja a linha Active:
. Diz "ativo" ou algum outro valor?
Se o serviço não estiver ativo e não estiver ativado, sua meta já foi cumprida.