Resolução de problemas de Modelagem Molecular TINKER

Question

Eu sou um estudante fazendo pesquisa de graduação. Estou usando o TINKER para modelagem (Link: link ). Eu sou novo no Linux e para este programa e queria saber se alguém aqui poderia me ajudar a solucionar problemas ou me ajudar a encontrar um lugar que me ajudará a solucionar problemas.

Atualmente, tenho o programa instalado e posso abri-lo usando o comando path no terminal Linux (configurei isso dessa maneira). Ele me pergunta pelo meu arquivo de coordenadas e eu insiro o nome do arquivo que quero testar. Isso então me faz a mesma pergunta. Eu continuo digitando o nome do arquivo e obtenho os mesmos resultados, o programa me pedindo para inserir os arquivos de coordenadas. Mesmo alguém que saiba apenas sobre programas Linux. Isso poderia ser um problema em como eu o configuro? Obrigado pessoal pela ajuda antecipada.

    

Answer 1

Não saber usar o programa tornará isso muito difícil!

Eu baixei o TINKER e os arquivos de exemplo, e se eu usar um nome de arquivo totalmente falso, o TINKER apenas solicita outro nome de arquivo. Não ter mensagens de erro torna o programa um pouco hostil para iniciantes.

Se eu especificar um nome de arquivo por caminho, por exemplo, ~/tinker/fulldist/tinker/example/hexanes.xyz Recebo uma pequena sinopse sobre hexanos e, em seguida, solicito outro nome de arquivo. Então, eu não acho que você tenha um problema de configuração, mas você provavelmente deve encontrar um colega que usa o programa e pedir um pequeno tutorial.