Não há problema em editar arquivos como root usando o gedit. Eu faço isso com frequência e sempre usarei o seguinte método, que é a maneira correta de usar o gedit com permissões de superusuário:
gksudo gedit /etc/pm/config.d/config
para editar um arquivo com permissões de root.
Não sei por que as downvotes, já que essa era a única resposta correta, a outra dizia usar outro editor. Então eu vou te contar e mostrar o porque.
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