O Ubuntu está lhe dizendo que usará todo o disco, sim, mas como o Ubuntu está rodando sob virtualização, o "disco inteiro" está se referindo ao disco virtual que você provavelmente criou quando criou a máquina virtual. O disco virtual, por padrão, é apenas um arquivo grande em seu disco físico real.
É possível dizer ao VirtualBox para usar um disco físico real para sua máquina virtual, mas esse não é o comportamento padrão, e você tem que sair um pouco do seu caminho para configurá-lo assim sendo. Então, a menos que você realmente tenha tomado essas medidas extras, meu primeiro parágrafo é quase certamente o que se aplica à sua situação.