Reinstalando bibliotecas compartilhadas ausentes 16.04

Question

• Estou usando um software de terceiros chamado FSL, uma ferramenta de neuroimagem.
  • Tive que desinstalá-lo com sudo apt-get remove fsl e sudo apt-get remove --auto-remove fsl .
  • Como um novato parente, eu entrei nele, mas depois percebi o que me levou a excluir, incluindo os cabeçalhos do kernel do Linux. Usando o comando find fsl não havia mais nada de fsl
  • Eu também usei locate fsl e deletei tudo o que pude para essa saída de comando.
  • Um sintoma está em execução sudo apt-get update parece não atualizar nada, já que posso executar continuamente o comando com a mesma saída

Tentando reinstalar, recebo dpkg: warning: files list file for package '$FILE' missing; assuming package has no files currently installed

Acho que causei um grande dano ao meu computador e não tenho certeza de todos os arquivos que excluí. Existe alguma maneira de descobrir quais bibliotecas compartilhadas estão faltando e reinstalá-las? Alguém pode ajudar? Devo apenas reinstalar o Ubuntu na minha máquina? Qualquer ajuda seria ótima.