Se o HDD estiver realmente vazio, você pode simplesmente usar o dd para copiar o ISO do Ubuntu para o drive, desperdiçando a maior parte do espaço de 2T, e inicializar para instalar no SDD. Depois, você pode simplesmente reparticionar o HDD e fazer outra coisa com o drive quando estiver pronto. A maioria das ferramentas para a gravação de ISOs vai a alguns comprimentos para evitar a gravação em um disco rígido, por medo de que você esteja cometendo um erro.