Mesmo problema, logado no Google, Minha Conta, fui para aplicativos conectados, gerenciar aplicativos, removi o Gnome Evolution, desconectei, reiniciei o ubuntu, quando apareceu o pop up, cliquei em allow e ele foi embora, isso parece ter resolvido o problema.
O bug só apareceu depois que eu instalei as atualizações mais recentes para o ubuntu 16.10