Sim, você faz. Nem baixa latência nem qualquer outro kernel vem com isso embutido.
Para construir o kernel, siga o link e ative o CONFIG_NO_HZ_FULL
O RHEL 7.0 permite o uso de nohz_full junto com algumas outras configurações para isolar certos núcleos de CPU para cargas de trabalho intensivas e interrupções de temporizador locais desativadas.
Como faço o mesmo no Ubuntu 16.04? Eu preciso de um kernel especial? Ou eu só preciso passar as opções? Preciso compilar meu próprio kernel?