Se você está se livrando totalmente do Ubuntu do seu sistema, a tela de resgate não importa. Se você estiver usando um USB inicializável e ainda conseguir resgatar, isso significa que você não está inicializando a partir do seu USB.
Primeiro de tudo você precisa descobrir por que você não é capaz de arrancar a partir do seu USB e consertar isso.
Depois disso, você deve inicializar a partir do CD live do Ubuntu e formatar o disco rígido para algo que o Windows possa ler (NTFS).
Por fim, inicialize o computador com um instalador do Windows.