Cada sistema Ubuntu que eu tenho acesso agora tem esta entrada (e a entrada que acompanha irc:x:39: in /etc/group também).
Como já foi dito que tem razões principalmente históricas. Como você pode ver que o diretório /var/run/ircd não existe, o "usuário" não pode efetuar login. Portanto, ele não tem consequências, mesmo em um sistema de produção.