Como você omitiu detalhes sobre o aplicativo real no momento, é muito difícil de adivinhar.
Eu tive situações semelhantes e geralmente descobri que o arquivo executável não teria permissões de execução.
Estou desenvolvendo um pacote snap que está tentando gravar em $ SNAP_DATA ou $ SNAP_COMMON, mas esses locais não parecem ser graváveis para o meu snap. Esses diretórios possuem proprietário e grupo como raiz e são graváveis apenas pelo proprietário. Quando eu executo meu snap usando "snap run my-snap", meu programa está simplesmente recebendo "Permission denied" ao tentar gravar em qualquer um desses locais.
Estou testando em uma máquina virtual Ubuntu 16.04.1.
Supondo que estes sejam graváveis, existem sugestões que possam resolver este problema?
Como você omitiu detalhes sobre o aplicativo real no momento, é muito difícil de adivinhar.
Eu tive situações semelhantes e geralmente descobri que o arquivo executável não teria permissões de execução.