Estou tendo problemas com o movimento lento do ponteiro do mouse no Ubuntu 16.10. O problema só ocorre depois de atividades gráficas intensivas, como reprodução de vídeos em 1080p, navegação em imagens de alta resolução ou jogos. Quando ele aparece, ele persiste até que eu reinicie o meu computador, mesmo o login e o logoff não ajudam. Além disso, o problema só aparece quando estou usando o touchpad integrado do meu notebook - quando eu conecto um mouse USB, o ponteiro se move como de costume (mas ainda demora quando tento usar o touchpad). Estou usando a placa NVIDIA GeForce 940MX com driver binário NVIDIA 367.57.
Eu encontrei uma solução para o meu problema. No começo eu reiniciei meu computador e entrei nas configurações do BIOS usando a tecla F2. Em seguida, alterei as configurações do Touchpad de Avançado para Básico.
Por favor, note que esta solução é susceptível de ser específica do hardware - eu estou usando o Acer Aspire E 15. Você também pode verificar este tópico nos fóruns do Ubuntu onde o encontrei.