Crie um script simples que irá extrair arquivos do diretório atual.
cat > /tmp/extract.sh <<'EOF'
#!/bin/bash
for x in "$@"; do
uncompress -f "${x}"
rm -f "${x}"
done
EOF
chmod 755 /tmp/extract.sh
Em seguida, use um comando find para percorrer os diretórios para executar a operação desse script em todos os arquivos.
find . -type f -name 'codg*.Z' -execdir /tmp/extract.sh {} +
O comando find deve ser executado a partir do diretório de seus arquivos baixados. Veja find(1)
man page e entenda as opções antes de executá-las.