Você pode usar o menu de limpeza do mkusb para criar uma nova tabela de partição e um sistema de arquivos. O padrão é uma tabela de partição MSDOS e uma partição com o sistema de arquivos FAT32. Veja os links a seguir,
help.ubuntu.com/community/mkusb
Editar:
Deacordocomsuasaídade
mkdosfs-F32-v/dev/mmcblk0
odispositivoéreconhecidocomoumdispositivodearmazenamentoemmassa.Taldispositivofuncionamelhorquandohápelomenosumapartição.Masvocêtentoucriarumsistemadearquivosdiretamentenodispositivo(semumaestruturadepartição)comocostumavaseremdisquetes,ecomoestánosdiscosdeCD/DVD.
Vocêpodecriarumatabeladepartiçõescomferramentasmanuais,porexemplogparted,masé"automática" com mkusb . Quando o gparted não funciona, suspeito que existam alguns dados, que confundam o gparted, e o mkusb sobrescreve esses dados com zeros (sobrescreve o primeiro megabyte).