Se você estiver usando o Unity, não o Gnome Shell, meu palpite é que o indicator-datetime não está em execução. Tente executar /usr/lib/indicator-datetime/indicator-datetime-service
de uma janela de terminal. Espero que isso conserte as coisas. Caso contrário, edite sua pergunta para incluir a (s) mensagem (ns) de erro exata (s) que você recebeu.
Para iniciar um terminal, pressione Ctrl + Alt + T . Você também pode digitar esse comando para obter uma lista de indicadores que estão em execução no momento:
ps -ef | grep [i]ndicator