Eu tive recentemente o mesmo problema por nenhuma razão aparente. Eu encontrei um vídeo do YouTube que resolveu - sim, eu tive que usar muito a pausa porque estava tocando muito rápido!
Eu estava usando meu laptop com um monitor externo via HDMI e mudei a saída de som para HDMI. Quando recebi o problema, não estava usando o monitor externo. A correção foi alterar minhas configurações de som de volta para 'Speakers - Built-in Audio'. O problema foi corrigido imediatamente.
Estou usando o Ubuntu 16.04.