Este é um recurso chamado rolagem natural . Ele foi projetado para tornar a rolagem mais intuitiva quando você está rolando com o dedo. Os dispositivos Mac OS e as telas sensíveis ao toque em smartphones e tablets rolam dessa maneira, mas as áreas de trabalho tradicionais, incluindo o MS Windows, rola para o outro lado.
O Ubuntu oferece rolagem natural para dispositivos touchpad por um tempo. Existe uma configuração para isso:
Em algumas versões, essa opção é chamada de "O conteúdo fica preso aos dedos" (isso não é muito intuitivo!):
No entanto, como você está usando um mouse e não um trackpad, não tenho 100% de certeza de que essa configuração funcionará ou estará disponível. Nesse caso, a resposta detalhada em esta questão deve ajudar.