Talvez isso possa ajudar você; Primeiro obtenha o processid com o comando ps com a opção u, use os comandos htop -p como abaixo;
#!/bin/bash
n=0;
while (( n++ < 3 )); do
{ sleep 3; killall htop;}&
htop -p $(ps -u root -u youruser | awk 'BEGIN{ORS=","} {print $1}')
done