Se você não pretende instalar o Linux no disco rígido, mas deseja inicializar o Windows e executar a partir do pendrive, sempre é possível instalar uma partição Linux muito pequena e mínima no disco rígido do Windows, para que você possa inicializar Windows do GRUB.
Você pode editar o GRUB para incluir a opção de inicializar a partir do pendrive:
Basicamente, é um caso de editar o arquivo de configuração e atualizar o GRUB para que ele reconheça tanto o Windows quanto o pendrive.