Uma solução que me vem à mente é:
id=$(ps -A | grep vim | awk '{print $1}')
para obter o (s) pid (s) do (s) programa (s) vim em execução e, em seguida, eliminá-lo com:
kill $id
é claro que você precisa salvar seu trabalho primeiro e depois fazer isso. Não tenho certeza de como seu programa salva o que foi feito!