Parece que seus arquivos ~/.config/dconf/user*
estão corrompidos. Tente o seguinte comando, ele deve recriar um novo e permitir que você armazene suas configurações persistentemente:
mv ~/.config/dconf/ ~/.config/dconf.bak
Observe que você pode perder algumas personalizações que você pode ter configurado em seu sistema, pois todas elas serão redefinidas.
Se isso não resolver o seu problema, tudo o que você precisa fazer é:
mv ~/.config/dconf.bak ~/.config/dconf/