Eu nunca descobri o que exatamente estava errado, mas sei que era uma questão de software; não só o sistema operacional era capaz de reconhecer o telefone Android Nexus 4 como um dispositivo de armazenamento (mas nenhuma outra unidade flash USB), mas quando eu inicializei usando um USB inicializável com o Ubuntu 14.04 LTS, funcionou muito bem. Eu era capaz de ligar e usar um segundo USB para armazenar meus dados de backup depois de montar o ssd da maneira usual através do Nautilus. Eu tive que usar a linha de comando 'sudo -i' para ser o usuário root antes de copiar as pastas, uma vez que minha pasta de início era protegida por senha anteriormente, mas tudo funcionou no final. Uma nova instalação subsequente do Ubuntu resolveu todos os problemas originais.
Moral da história: seja qual for o problema, foi corrigido por uma nova instalação, precedida por backup através de uma versão inicializável por USB do Ubuntu.