Você pode usar o 'canivete suíço' gnome-disk-utility
para criar a mídia de instalação do Windows. Abra Disks
do painel e selecione Restaurar imagem do disco no menu no canto superior direito do aplicativo. Escolha o arquivo de instalação do Windows e a unidade USB para gravá-lo. Clique em Iniciar restauração, agora você deve conseguir inicializar a partir da mídia USB do Windows corretamente.