Isso pode ser uma correção temporária viável. Volte para o VB 5.0.x. Nenhum conteúdo flash ou HTML5 seria reproduzido em uma das VMs dos meus hosts, mas funcionava perfeitamente em outras. Acontece que estava trabalhando na máquina rodando o virtualbox 5.0.26, enquanto o outro sempre congelava às 0:00 quando rodando sob o 5.1.8. Ambos estão em sistemas operacionais host Win10.
Eu fui em ambas as direções para confirmar. Eu atualizei o 5.0.26 para o 5.1.8 e executei a mesma VM, instalando as novas adições de convidado e as atualizações de software: tudo em flash e o HTML5 não pôde ser executado. A outra máquina que eu desinstalei do virtualbox, reinstalado com o 5.0.28, carregou a VM existente com adições de convidado e atualizações de software, e o flash / HTML5 funcionou perfeitamente.
Ambas as VMs tinham a mesma versão do flashplayer (11.2.x.644) e nenhuma configuração foi alterada, então o problema é algo relacionado a como o 5.1.x funciona com o kubuntu.