Este é o bug 1173457, o instalador não configura corretamente o EFI em mídia remota (USB no bug, mas você pode adicionar sua informação sd). Você pode copiar tudo, desde a partição EFI do disco rígido até a partição EFI do SD para ver se funciona, ou você pode tentar inicializar o disco rígido e selecionar o ubuntu (shim / grub). Experimente o menu EFI (algumas teclas de função na energização para selecionar disk / os para inicializar). E adicione-se ao bug, ele tem três anos e poucos estão na lista, mesmo que todos que tentaram instalar em um UEFI tenham sido afetados.
Note que o grub-install foi atualizado um pouco para permitir uma instalação manual na mídia remota, mas o switch "secure" não usa corretamente o shim em vez do grub.
O boot-repair não sabe sobre os dispositivos mmcblk, mas se você colocar o cartão SD em um leitor USB, talvez consiga consertá-lo.