Tente atualizar seu driver de kernel da Wacom:
http://linuxwacom.sourceforge.net/wiki/index.php/Input-wacom
e seu driver Wacom X:
http://linuxwacom.sourceforge.net/wiki/index.php/Xf86-input-wacom
É mais provável que seja o seu driver X nesse caso, então você pode querer tentar primeiro.