Não é uma resposta como tal, embora eu tenha inadvertidamente se livrado do segundo cursor!
Estou recebendo o mesmo problema - de forma intermitente - desde que atualizei a partir de 14.04 também.
Curiosamente, a "solução" foi passar o mouse sobre a imagem que você postou! Eu abri-lo para ver se era o mesmo problema que o meu e assim como eu estava percebendo o ponteiro superior parece ser o ponteiro "ativo" em que ele muda de ícones como o contexto muda - o segundo ponteiro desapareceu como eu movi-lo para fora a janela da imagem!
Ele não se recuperou, embora eu tenha movido de janela em janela (uma das minhas telas também é girada em 90 graus) e eu troquei janelas. Ainda para reproduzir o problema, mas eu estou bookmarking esta questão para ver se passar o mouse e depois fora da janela de imagem funciona novamente!