Eu me deparei com um problema semelhante e depois de fazer muita pesquisa eu encontrei Como eu corrijo meu drive USB para obter o tamanho original de 8GB de volta?
Agora, certifique-se de usar isso com extremo cuidado, pois você pode acabar formatando acidentalmente o dispositivo errado. Isso ocorreu quando o Windows tentou "consertar" uma unidade USB que estava conectada a um sistema Linux anteriormente.