Eu não sei se isso vai ajudar, mas funcionou para mim. Eu estava olhando para atualizar o GDAL, e desde que eu tinha instalado manualmente a partir da fonte, eu queria desinstalar a versão antiga primeiro. Então eu li em algum lugar (desculpe, mas eu tinha tantas abas abertas que não posso encontrá-lo agora) que eu deveria apenas instalar o pacote mais recente e que iria substituir o anterior. E eu li outro comentário dizendo da próxima vez ao invés de usar sudo make install
eu deveria usar sudo checkinstall
que cria um pacote deb que é desinstalevel rodando sudo dpkg -r <name_of_your_package>
então acabei de instalar a versão que tive com sudo checkinstall
(sobrepondo o que eu tinha e a criação do pacote) e, em seguida, desinstalei o uso de sudo dpkg -r gdal
. Eu sei que não é a coisa mais elegante, mas funcionou para mim.