Provavelmente não, isso é bug 1265192 , "Instalar / reinstalar apaga todos os outros partições ". Você pode se adicionar à lista "este bug me afeta" clicando no ícone amarelo ao lado da pergunta.
Eu tive alguns grandes problemas com o meu upgrade do Ubuntu a partir de 14.04 (ficou preso por algum motivo em uma falha 15.10). Para resolver, eu fiz um Ubuntu 16.04 live USB para reinstalar. Quando inicializei o USB e selecionei a opção de instalação, selecionei a primeira opção para Upgrade 15.10 to 16.04. Durante a instalação, ele pediu o nome do meu computador e também meu nome de usuário.
Após a instalação, parece que tenho uma instalação completamente nova do 16.04, apesar das minhas instruções.
Tenho alguma esperança de recuperar minha configuração sobrescrita existente?
Provavelmente não, isso é bug 1265192 , "Instalar / reinstalar apaga todos os outros partições ". Você pode se adicionar à lista "este bug me afeta" clicando no ícone amarelo ao lado da pergunta.