Fácil de consertar, você deve montar o sistema de arquivos raiz "read write".
Executar no aplicativo Terminal (quando ele solicitar senha, tente o código de desbloqueio do telefone):
$ sudo su -
# mount -o remount,rw /
# apt-get update
Após a atualização, remontar o sistema de arquivos de volta para somente leitura:
# mount -o remount,ro /